MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora arenicola CNS-205 chromosome

Total Repeats: 135800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009953	CGAC	2	8	158	165	25 %	0 %	25 %	50 %	159035675
2	NC_009953	CGA	2	6	185	190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
3	NC_009953	CGA	2	6	204	209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
4	NC_009953	GCA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
5	NC_009953	TCG	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
6	NC_009953	GTCC	2	8	285	292	0 %	25 %	25 %	50 %	159035675
7	NC_009953	CCG	2	6	357	362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
8	NC_009953	GGCC	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	159035675
9	NC_009953	GGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
10	NC_009953	GAC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
11	NC_009953	ACC	2	6	527	532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035675
12	NC_009953	CGA	2	6	539	544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
13	NC_009953	GCC	2	6	666	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
14	NC_009953	TGG	2	6	690	695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159035675
15	NC_009953	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
16	NC_009953	CGAC	2	8	722	729	25 %	0 %	25 %	50 %	159035675
17	NC_009953	CG	3	6	770	775	0 %	0 %	50 %	50 %	159035675
18	NC_009953	ACC	2	6	839	844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035675
19	NC_009953	CGG	2	6	849	854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035675
20	NC_009953	GGA	2	6	858	863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
21	NC_009953	CCG	2	6	881	886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
22	NC_009953	GGC	2	6	892	897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035675
23	NC_009953	TCG	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
24	NC_009953	CTG	2	6	1051	1056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
25	NC_009953	ACG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
26	NC_009953	GAG	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
27	NC_009953	TCA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159035675
28	NC_009953	CGA	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
29	NC_009953	TCC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159035675
30	NC_009953	CGA	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
31	NC_009953	AGG	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
32	NC_009953	TTC	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159035675
33	NC_009953	CAA	2	6	1290	1295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159035675
34	NC_009953	AGC	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
35	NC_009953	GGA	2	6	1344	1349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
36	NC_009953	CCT	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159035675
37	NC_009953	GCC	2	6	1395	1400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
38	NC_009953	AGA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159035675
39	NC_009953	GCC	2	6	1438	1443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
40	NC_009953	CCG	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
41	NC_009953	GTC	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
42	NC_009953	GAG	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035675
43	NC_009953	TGC	2	6	1595	1600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035675
44	NC_009953	CCG	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035675
45	NC_009953	TGG	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159035675
46	NC_009953	ACT	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159035675
47	NC_009953	CGCC	2	8	1728	1735	0 %	0 %	25 %	75 %	159035675
48	NC_009953	GACC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	25 %	50 %	159035675
49	NC_009953	ACCAC	2	10	1811	1820	40 %	0 %	0 %	60 %	159035675
50	NC_009953	CAG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035675
51	NC_009953	TGA	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159035676
52	NC_009953	GCCG	2	8	2772	2779	0 %	0 %	50 %	50 %	159035676
53	NC_009953	CGGTGC	2	12	2781	2792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159035676
54	NC_009953	TGC	3	9	2802	2810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035676
55	NC_009953	GCC	2	6	2900	2905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
56	NC_009953	CCGG	2	8	2913	2920	0 %	0 %	50 %	50 %	159035676
57	NC_009953	CGG	2	6	2970	2975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
58	NC_009953	CCA	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035676
59	NC_009953	GGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035676
60	NC_009953	GCACCG	2	12	3072	3083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159035676
61	NC_009953	CGC	3	9	3088	3096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
62	NC_009953	CGC	3	9	3100	3108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
63	NC_009953	GGC	2	6	3127	3132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
64	NC_009953	GAT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159035676
65	NC_009953	CGG	2	6	3184	3189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
66	NC_009953	ACCG	2	8	3209	3216	25 %	0 %	25 %	50 %	159035676
67	NC_009953	GAC	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035676
68	NC_009953	CGG	2	6	3331	3336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
69	NC_009953	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	159035676
70	NC_009953	CGC	2	6	3404	3409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
71	NC_009953	ACC	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035676
72	NC_009953	CCG	2	6	3443	3448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
73	NC_009953	TC	3	6	3455	3460	0 %	50 %	0 %	50 %	159035676
74	NC_009953	GC	3	6	3501	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	159035676
75	NC_009953	GTC	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035676
76	NC_009953	CAC	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035676
77	NC_009953	CTG	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035676
78	NC_009953	GCG	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
79	NC_009953	TGG	2	6	3585	3590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159035676
80	NC_009953	CGG	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035676
81	NC_009953	AGCGA	2	10	3623	3632	40 %	0 %	40 %	20 %	159035676
82	NC_009953	TC	3	6	3697	3702	0 %	50 %	0 %	50 %	159035676
83	NC_009953	CCG	2	6	3720	3725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035676
84	NC_009953	TCGT	2	8	3731	3738	0 %	50 %	25 %	25 %	159035676
85	NC_009953	CGGT	2	8	3768	3775	0 %	25 %	50 %	25 %	159035676
86	NC_009953	TCA	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159035676
87	NC_009953	GGC	2	6	3910	3915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035677
88	NC_009953	GC	3	6	3933	3938	0 %	0 %	50 %	50 %	159035677
89	NC_009953	CG	3	6	4030	4035	0 %	0 %	50 %	50 %	159035677
90	NC_009953	CGA	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035677
91	NC_009953	CAT	3	9	4110	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159035677
92	NC_009953	CGG	2	6	4122	4127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035677
93	NC_009953	CGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035677
94	NC_009953	ACGTCG	2	12	4190	4201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159035677
95	NC_009953	CGG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035677
96	NC_009953	CGG	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035677
97	NC_009953	GCCG	2	8	4305	4312	0 %	0 %	50 %	50 %	159035677
98	NC_009953	GCCGG	2	10	4333	4342	0 %	0 %	60 %	40 %	159035677
99	NC_009953	GTC	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035677
100	NC_009953	GCT	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035677
101	NC_009953	CG	3	6	4522	4527	0 %	0 %	50 %	50 %	159035677
102	NC_009953	CGA	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035677
103	NC_009953	GGA	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035677
104	NC_009953	CGC	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035677
105	NC_009953	CGC	2	6	4701	4706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035677
106	NC_009953	CAG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035677
107	NC_009953	GTAC	2	8	4768	4775	25 %	25 %	25 %	25 %	159035678
108	NC_009953	TCG	2	6	4788	4793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035678
109	NC_009953	GCG	2	6	4964	4969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035678
110	NC_009953	GGT	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159035678
111	NC_009953	GGGC	2	8	5033	5040	0 %	0 %	75 %	25 %	159035678
112	NC_009953	TCGG	2	8	5055	5062	0 %	25 %	50 %	25 %	159035678
113	NC_009953	CCCGG	2	10	5065	5074	0 %	0 %	40 %	60 %	159035678
114	NC_009953	GGA	2	6	5122	5127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159035678
115	NC_009953	GCC	2	6	5160	5165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035678
116	NC_009953	GAC	2	6	5174	5179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035678
117	NC_009953	CTG	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035678
118	NC_009953	GGT	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159035678
119	NC_009953	CTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035678
120	NC_009953	CGG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159035678
121	NC_009953	GAC	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035678
122	NC_009953	CG	3	6	5341	5346	0 %	0 %	50 %	50 %	159035678
123	NC_009953	TCGAC	2	10	5371	5380	20 %	20 %	20 %	40 %	159035678
124	NC_009953	ACG	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035678
125	NC_009953	GCC	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035678
126	NC_009953	GCC	2	6	5444	5449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035678
127	NC_009953	ACC	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035678
128	NC_009953	CTGAC	2	10	5502	5511	20 %	20 %	20 %	40 %	159035678
129	NC_009953	CGC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035678
130	NC_009953	ACC	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159035678
131	NC_009953	GAC	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159035678
132	NC_009953	GCCA	2	8	5636	5643	25 %	0 %	25 %	50 %	159035678
133	NC_009953	CTG	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159035678
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388	NC_009953	GTT	2	6	18308	18313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159035690
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499	NC_009953	GCC	2	6	23330	23335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159035693
500	NC_009953	GTA	2	6	23353	23358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159035693

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